一是强化监测预警，持续做好传染病常态监测和应急监测。积极推进地区二级及以上公立医疗机构国家传染病智能监测预警前置软件服务器软硬件环境配置工作。截至2024年12月31日，地区无甲类传染病报告，未发生影响社会运行的重大突发公共卫生事件。二是持续抓好重点传染病防控工作。在坚持落实主动发现、隔离治疗和“集中服药+营养早餐”新疆模式的基础上探索“2+2+N”阿克苏防治模式，地区结核病发病率下降明显。全面实施地区第五轮全国艾滋病综合防治示范区项目，加强基层艾滋病专干配备，探索推行患者村级随访管理、“四病同防同治”和“智能化监管服药”等“阿克苏地区特色”防控模式，艾滋病新报告发病人数呈现下降趋势。三是持续做好地方病、人畜共患病等防控工作。开展居民合格碘盐食用率监测，持续保持碘缺乏病消除状态。完善地区人兽共患病联防联控机制，协同农业农村部门开展联防联控会议，做好布病综合防治工作。将阿克苏市人民医院、温宿县人民医院、沙雅县人民医院、新和县人民医院、拜城县人民医院、乌什县人民医院、阿瓦提县人民医院建设成国家重大公共卫生补助资金包虫病外科治疗项目定点医院。
二、免疫规划工作适龄儿童常规免疫接种率达98%以上，非免疫规划疫苗接种点位“乡乡全覆盖”，打造智慧化接种门诊2家，数字化预防接种门诊33家，地区共储备各类疫苗4万余人份，积极做好疫苗接种服务工作，筑牢全民免疫屏障。